流行性出血热系由汉坦病毒所致的以啮齿类动物为主要传染源的自然疫源性疾病。在中医学当属温疫。病源当为湿热疫毒，或称暑秽之邪。如石寿棠曰：“温疫，病如役扰，乃浊土中湿热郁蒸之气，而化燥最速者也。”（《医原·百病提纲》）。“至于暑，即湿热合邪，酝酿为害”（《医原·湿气论》）。湿本水邪，热本火毒，同气相求，邪入少阴。水邪入肾伤气，火毒入络动血。肾与血络受损乃其病理特征。以水流湿，火就燥，故易于生湿化燥，而证现燥湿两端。至其发病，多由新感引动伏气。邪自少阴而出，舍于肾之所合（膀胱），而上并于太阴阳明。由是内外合邪，卫气同病，发病即现中上二焦见症。邪正交争故发寒热，湿郁经脉乃见三痛；热炽阳明，乃见三红；湿热中阻，脘痞呕恶。继而三焦蔓延，蒙上流下。上蒙清窍则头晕目暝，下流浊道则便溏溲赤。三焦均受，湿热交蒸。热蒸则湿动，热烁则燥成。湿动者，津液渗出，泛溢肌肤，聚湿为肿；燥成者，津亏血燥，血热浓凝，血瘀血溢。邪羁不去，正气日亏，气阴大伤，诸阳式微，是以身热骤退而病反加重，现出少阴本经症候。此时外候已无热，惟湿燥互见。其湿盛者，湿遏阳气，阳郁不达，可至厥逆；湿伤肾气，气化不利，可致少尿。其燥胜者，津枯血凝，气血不运，可致气脱；燥伤肾阴，瘀阻肾络，可致尿闭。小水既闭，邪无出路，下闭上壅，变在斯须。湿壅盛者，可致水凌心肺，发为喘满；浊壅盛者，可致尿毒上脑，发为痉厥。燥烈盛者，可致尿毒入血，出血加重；瘀阻包络（脑络），神明逆乱。若度过少尿期，则肾气渐复，三焦气化得通，停聚之水湿得行，大气一转，津液来复。惟肾虚不藏，是以多尿。由是邪有出路，湿祸渐减；水津流布，燥祸亦衰。湿尽燥清，乃趋于恢复。
病由湿燥为患，治之之法，大要为清热以宁络，祛湿以安肾，使邪早有出路。初起湿郁热炽，表邪外束，治当辛凉清解，宣气化湿，叶氏荷杏石甘汤主之。药用薄荷、杏仁、石膏、知母、甘草、竹叶、细辛。继之三焦蔓延，湿热交蒸，治当辨其在气在血。其燥未成邪在气分者，主以三石汤清热利湿，宣通三焦。药用滑石、石膏、寒水石、杏仁、竹茹、银花、通草、金汁（人中黄代）。若燥已成，内搏血分者，先与紫雪丹，再与犀地清络饮。药用水牛角、生地、丹皮、赤芍、桃仁、竹沥、姜汁、石菖蒲、连翘、茅根、灯心，以凉血散瘀、清心开窍而利小便。此发热期之治，盖不离乎治暑之法——清心利小便。用之及早，可使越期而过。
低血压休克期主症为厥脱，证有湿燥之分。其湿胜者，阳气被郁，虽或肢厥脉伏，不过一过性低血压，治宜五苓散利水通阳。若燥胜者，津枯血凝，络道瘀阻，气血不足，正虚气脱，症见面色灰白，口唇青紫，四肢厥冷，大汗淋漓，神倦息促，斑疹显露，烦躁不安，甚或神昏痉厥。治当急救其脱，立予生脉散合参附汤煎汤急进，不拘时服。静滴参附生脉及香丹以益气养阴，回阳固脱，活血散瘀。若见神昏痉厥，即为内闭外脱，另予独参汤送服安宫牛黄丸，以开闭回脱。
少尿期为本病极期，主症为小便不利，呕逆不已，是为关格。其尿少未闭者，肾尤未败，治之稍易，然有湿燥之别。湿气胜者，面目浮肿，球结膜水肿，小便胶浊，为湿伤肾气，气化不利。此证忌润，润之是为以水济水。当利之，宜吴氏猪苓汤：猪苓、泽泻、木通、滑石、车前、灯芯煎服。若燥胜者，口燥咽干，眼眶凹陷，尿中或有膜状物，乃热结液干，水府乏源，不可利也。强利则为砻糠打油。当润之，宜冬地三黄汤：麦冬、生地、玄参、黄连、黄芩、黄柏、甘草、苇茎汁、金银花露、甘苦合化阴气。至若尿闭（24h尿量<100ml），乃湿伤肾气，燥伤肾阴，瘀阻肾络，至肾气衰败，关门不利，水道不通，湿浊壅滞。症见二便俱闭，呕吐呃逆，周身浮肿，脘闷腹痛，衄血瘀斑，苔腻腐黄褐，脉沉缓实大。其证湿、燥、瘀、毒俱盛，润之不可，利之无益，惟当攻下通腑，逐其秽浊。何梦瑶曰：“小便闭，行大便则小便通，利水药无益也”（《医碥·温疫病论》）。当急下之，宜大承气汤。闭结甚承气下之不通者，可与大陷胸汤。惟其格塞太甚，汤药难进，是以直取一味甘遂攻之。法以醋甘遂为末，名曰“关格散”，装入胶囊，每服1~1.5克。药后必下，小便续通。此法疗效可靠，屡验不爽，举凡大剂西药利尿导泻不效者，用之皆效。且可大大缩短少尿期病程。一般药后12小时内即解除尿闭，24h尿量>500ml,进入增尿阶段。
若应下失下，酿成变证者，亦当随其湿燥而救之。水湿壅盛，水凌心肺，喘喝息高，烦躁不安，咯吐粉红血水者，为肺之化源绝，乃温病第一死法。救之者当急逐其水。寻常泻肺利水之方不中与也，宜桔梗白散。浊毒壅盛，尿毒上脑者，头痛呕吐，黑蒙，或卒然发痉如癫痫，甚或神昏痉厥不省人事，为痰蒙神窍，浊邪害清也。立予“关格散”泻其浊，玉枢丹开其闭，安宫牛黄丸或苏合香丸芳香开窍醒神。若燥胜者，尿毒入血，大片瘀斑，上下失血，可与陈氏夺命饮（《疫痧草方》）“清利内肾溺毒”。药用羚羊角、水牛角、生地、丹皮、赤芍、黄连、沙参、连翘、马勃、青黛、土贝母、人中黄、生石膏。若血毒攻心，瘀阻脑络，神昏如狂者，加服犀珀至宝丹，上清脑络，下降浊阴。
至多尿期，症见小便频数量多，口渴引饮，舌红少津，脉虚细，为肾虚不固，膀胱不约。然亦邪求出路，但滋肾水，不必收涩，六味地黄汤主之。可加参、芪、麦、味以益气阴。至恢复期，诸症悉除，惟余虚象，多由瘥后肾虚，虚者补之，以平为期。
上言证治大略，要在及早攻邪。而攻邪之道，在使邪有出路。出路者何？肺、胃、大肠、膀胱是也。开肺气，利膀胱，清胃通腑，是之谓启上闸，开支河，导湿下行以为出路。盖肺主一身之气，气化则湿自化。湿本为水，是为膀胱之邪，还从膀胱去，所谓“治湿不利小便，非其治也”。燥为阳明之邪，清胃即所以防燥。若夫通腑，釜底抽薪，固治燥救阴不易之法，是之谓“阳明之邪仍假阳明为出路”也。惟逐邪勿拘结粪，乃逐其邪水。然而邪水旺则真水亏，逐邪水即所以救真阴也。
